Имеется железка:
Device Type : DGS-3120-24SC Gigabit Ethernet Switch
Boot PROM Version : Build 2.00.003
Firmware Version : Build 3.00.B040
Hardware Version : A2
Firmware Type : EI
Serial Number : R3EL1C8000896

Собран транк между этой железкой и джунипером ex-3200 в 4 гигабитных порта.
Link Aggregation Algorithm = MAC-Source. Балансировка на портах работает некорректно, т.е. на одном порту 900 мбит, а на других по 150-300 мбит. Как настроить правильно балансировку на портах.

делайте по IP, будет гораздо лучше. Настраивать нужно с обеих сторон

Зависит от адресов MAC IP в трафике проходящих через интерфейс. Вам должно быть виднее какой алгоритм нужен. Однозначно сказать, что лучше тот или другой алгоритм, невозможно без анализа того какой трафик ходит. Читайте доку, смотрите что у вас ходит по этому интерфейсу.