У меня такая же проблема с DGS-3100-24TG
Есть 2 проблемных коммутатора.
1. Подключен от Сisco 3560G, на питающем порту ошибок нет.
Прошивка 3.60.38
Вланы совпадают с обоих сторон. Аксес листов нет.
# sh utilization ports 24
Port TX/sec RX/sec Util
----- ---------- ---------- ------
1:24 50897512 61748376 6%
# sh utilization cpu
CPU utilization
-----------------------------------------------------------------------------
Five seconds - 10% One minute - 10% Five minutes - 10%
Потери на питающем порту.
С физикой все ок (меняли порты и патчкорды с обоих сторон).

2. Подключен от Cisco 3650G
Прошивка 3.60.30
Вланы совпадают с обоих сторон. Аксес листов нет.
# sh utilization ports 4
Port TX/sec RX/sec Util
----- ---------- ---------- ------
1:4 62968904 70649664 7%
# sh utilization cpu
CPU utilization
-----------------------------------------------------------------------------
Five seconds - 25% One minute - 19% Five minutes - 19%
# sh ports 4
Port Port Settings Connection Address
State Speed/Duplex/FlowCtrl Speed/Duplex/FlowCtrl Learning
--- ------- ------------------ ------------------ -------
1:4 Enabled Auto/Disabled 1000M/Full/Disabled Enabled
Так же потери на питающем порту. С физикой тоже все ок.

Если пингуем с маршрутизатора, потери пакетов 1-2% в обоих случаях.
Очень охота решить данный вопрос.