как настроить vlan"ы на коммутаторе что-бы с разных VLan имелось доступ к сервреу Novell Netware 4.0 по протоколу IPX ?
или этот протокол уже неизпользуется?...

Коммутаторы D-Link не умеют маршрутизировать протокол IPX, поэтому "в лоб" такая задача не решается.

Однако можно предложить несколько обходных вариантов:
1. В netware-сервер ставите столько сетевых адаптеров (физических или виртуальных), сколько виланов в вашей сети должны иметь доступ к этому серверу. (Что касается виртуальных адаптеров - тут я не вполне уверен, что "нетварная" версия 4.0 поддерживает "вилановый" стандарт 802.1q). К каждому из адаптеров привязываете протокол IPX и уникальный IPX-адрес сети, а затем каждый из сетевых адаптеров подключаете в свой собственный VLAN. В результате имеете правильную сегментированную IPX-сеть.

2. В качестве маршрутизатора можно пользовать линуксовый сервер с множеством сетевых интерфейсов (опять же физических или виртуальных) - по одному на каждый VLAN. Маршрутизация там работает на уровне ядра, а потому достаточно шустрая. Единственно, что придётся повозиться с IPX-маршрутными таблицами: либо забивать их "статикой", либо настраивать какой-нибудь софт, выполняющий функции IPXRIP и IPXSAP.

3. Если клиенты подключены к коммутаторам, которые поддерживают стандарт 802.1v (protocol-based vlan), то можно создать специальный VLAN только для протокола IPX, и всех клиентов, которые должны иметь доступ к netware, дополнительно включить в этот VLAN. В этом случае, однако, придётся на сервере в обязательном порядке использовать тип фрейма ethernet_ii (802.3 и 802.2 не "прокатят"), ибо только для этого фрейма в сетевых пакетах можно однозначно идентифицировать тип протокола как IPX по номеру 0x8137. Кроме того, надо понимать, что все netware-клиенты окажутся в одном общем широковещательном IPX-сегменте.