хочу соединить два офиса через 6004 (по ЕХТ). смогу ли при этом пользоваться операторами воип, типа sipnet.ru?

Смотря как настраивать, а вообще да

каким образом в них разруливаются звонки, которые подут в другой офис, т.е. на другой 6004, и внешние звонки, которые пойдут на сипнет?

Ну например, можно звонить и через сипнет на локальные номера, в этом случае сипнет денег не берет.
(Только с 9 февраля ввели абонентку 1 доллар в месяц с номер и нигде инфы не было, случайно узнал)

нет, мне нужно как бы два направления: одно, условно короткое, для связи между офисами, т.е. набрал короткий номер для выхода на 6004, 6004 связался с другим 6004, набрал номер конкретного абонента на другой атс.

другой: через сипнет куда попало


ну, т.е. поставить еще один 5004/6004 не проблема, интересно, смогу ли использовать один 6004 для двух целей/направлений

так можно будет и короткие номера использовать, например в том же сипнете настроить телефонную книгу, или на самих устройствах подмену номера. связь, как я понимаю будет проходить все равно через внешние линии связи.
Но если вас такое решение не устраивает, можно поставить какой либо сип-прокси.

как раз 6004 цепляются к внутренним, ЕХТ линиям атс.