При подключении клиента создаётся соединение, но не функционируют сервисы, такие как DNS.
Следуя этому совету http://support.dlink.com/faq/view.asp?prod_id=1153, были настроены соответствующие виртуальные серверы, выключен ipsec pass through и выключены keep-alive в клиенте. Но результат тот же.
версия прошивки 1.03 A1
при подключении через linux-роутер, всё работает отлично.
Есть ли ещё способы заставить его работать корректно?

Что вообще с этим роутером не так? С ним ssl ещё не корректно работает и почта тоже. Так ещё и dns перестаёт иногда работать, приходится перезагружать.

Попробуйте уменьшить MTU на WAN интерфейсе роутера.