DIR-300/NRU firmware 2.05

Ни в какую не поднимает PPPoE сессию в режиме 10/100 Аuto и 100, только принудительное выставление на 10 half duplex роутер подключается и работает. (К сожалению, прошивка не даёт возможности принудительно выставить хотя бы 10 full duplex)

Комп подключенный напрямую без роутера с этим же кабелем линк 100 Мбит поднимает, проблема явно не из-за длины или состояния витой пары до свича провайдера. Тем более для проверки втыкался свитч между лямкой провайдера и роутером, на индикаторах видно, что до прова сразу загорается 100 Мбит линк, а в сторону роутера видны только попытки, мигания. Если на свиче (управляемом) зажать на порту 10 мбит (даже full duplex) роутер успешно соединяется.

Вот интересно, что может отвалиться в роутере, что делает невозомжным линк в 100 мбит на WAN порту?

Отвалиться в нем не чего не может, так как это пяти портовый switch с определенной конфигурацией портов с помощью регистров чипа данного устройства.
Для пользовательским управлением конфигурацией портов в данном ПО не предусмотрено меню, но и ответа я думаю тех.поддержки тоже не услышите.
А pppoe тут не причем, лучше попробуйте просто подключить любой лок.порт к провайдеру и посмотрите через ПК что покажет роутер, какое соединение, или на доп.switch попробуйте.

Понятно, что ни при чем, тут, наверное, на физическом уровне дело. На локальных портах роутера с этим проводом 100 Mbit full duplex без проблем.
Странно, используются ведь те же пары и при 10 и при 100, что могло сулчиться с портом, не понятно

Вы не поняли разработчики ПО при инициализации устройства в данном случае пяти портов используют одно и тоже значение например записывают 0х3300 в регистр которое говорит о такой-то скорости на этом порту, данное значение будет записано во все пять регистров отвечающих за пять портов. В противном случае можно сделать вывод:
- порт брак, не проходит инициализацию, ну например залип определенный бит и получается другое значение, так как данные хранятся в памяти (flash), а она иногда бывает сбоит, и сбой как раз в том месте где именно в наш регистр для WAN порта посылается значение, но естественно не 0х3300, а какое то другое, сброс и выключение тут не помогут, только перепрошивка с обнулением (т.е. сброс настроек как при покупке)
- проблема с оборудование на другом конце, так ПО не какого отношения к авто согласованию скоростей еthernet не имеет

Вот ну ни как не хочет D-link сделать меню для переконфигурации портов, из 5 портов обычно используются 2 (WAN и один LAN) и Wi-Fi, ну например WAN загнать на LAN1, а данный LAN1 на место того WAN если надо.

Что вы мучаетесь, прошейте wive-rtnl, в этой прошивке используется более новая версия модуля для инициализации портов. Да и скорость/дуплекс для каждого порта в этой прошивке можно отдельно выставить.

Я думал он сам догадается.