После перезагрузки по питанию свитча DES-3526 не появляется линк на оптических портах, после вытаскивания модулей или волокон проблема как правило решается. Прошивка Build 5.01-B30.
Как решить эту проблему и сталкивался ли кто с ней?

Сталкивался с подобным, были большие потери в одном волокне, помогла смена плохого волокна на запасное.

Также желательно обновить прошивку на ту которую я вам выслал.

Какая серия коммутатора . ?
При начальных стадиях умирания блоков питания в первую очередь отказываются стабильно работать именно комбопорты.
Так же подобное может происходить при работе SFP модуля в паре с конвертором dlink. На конверторе dip переключателем следует изменить режим работы.