Есть сеть из двух DGS 1216T при пинге отклик достигает 1 секунды, даже при подключении одной машины.
В чем проблема?

Аппаратная ревизия устройства и версия прошивки?

Rev: C1
версия прошивки 3.00.17

Это нормальная ситуация с этим устройством. На коммутацию трафика это не влияет.

У нас в сети машины под Linux и при загрузке бывает ошибка сетевого интерфейса и при объединении нескольких сетей на одном свиче эта ошибка появляется очень часто и пинг бывает тогда до 2,5 секунд.

Вариант только один поменять коммутаторы на другие серии.

У нас они объединены по оптике и заменить нет возможности.
Это вообще гарантийный случай?

Нет, я же объяснил что это особенность этих устройств. Вы же говорите в оригинальном посте про пинг до интерфейса коммутатора. Перезвоните пожалуйста в офис по телефону 744-00-99 доб.390.