1) Процедура перепрошивки описана здесь
http://www.dlink.ru/technical/faq_hub_switch_62.php
2) Настройки не теряются. Просто желательно сразу после перепрошивки до перезагрузки ввести команду save.
3) Перед добавлением в стек коммутатор должен иметь ту же прошивку, что и те которые уже в стеке. Т.е. либо снчала обновляете прошивку в вашем стеке, потом на новом коммутаторе и только полсе добавляете в стек. Либо второй вариант заливаете на новый коммутатор ту же прошивку что и в стеке, добавляете в стек и затем препрошивает новой прошивкой весь стек. Но лучше первый вариант. Прошивку берите с ftp
ftp://ftp.dlink.ru/pub/Switch/DES-3226S/Firmware версия 4.02-B52.
4) В ауказанной прошивке сохранится управление через WEB-интерфейс.
5) Проблем быть не должно.