к DGS-3426 подключена Cisco если не ошибаюсь 3550.
Между ними DMC-920. Порты транковый, 2 влана в нем, порты выставленны в Авто.
На киске на порту ни каких ошибок. На Длинке на порту растет счетчик DropPkts и VlanIngDr.
При этом пинг дает примерно 15% потерь.
Эти проблемы по всей видимости были и раньше но пока скорость была не большой то не обращали внимание на 2-3 пакета потерянные на 1000.

Попробовал в том числе:
отключил Ingress Check - счетчик VlanIngDr перестал расти, DropPkts растет, потери есть
отключил Ingress Check, прописал PVID равный одному из вланов - счетчик VlanIngDr перестал расти, DropPkts стал расти меньше, но не заметно чтобы потери уменьшились.
на Cisco сделали порт аксэсным, при этом самое интересное трафик не пропал, перевел на длинке в аксесс и трафик пропал, вернул в транк - трафик есть, минуты через три пропал, сделал аксесс - трафик пошел, но все равно даже в аксессе потери есть.
порты с обоих сторон поменяли - ни чего не поменялось.
ACL, QOS и прочее не прописаны вообще, STP включен но на порту Disable и BPDU тоже отключены.
На других портах с другими подключениями такого не наблюдается ни на киске ни на длинке.

Как настроены вланы на DGS на портах и PortChannal на кошке?

я где-то упоминал PortChannal ?

interface GigabitEthernet1/0/11
switchport trunk encapsulation dot1q
switchport trunk allowed vlan 4,5
switchport mode trunk
duplex full
no mdix auto
-------------------------------------------------------------------------

#sho interface GigabitEthernet1/0/11 trunk

Port Mode Encapsulation Status Native vlan
Gi1/0/11 on 802.1q trunking 1

Port Vlans allowed on trunk
Gi1/0/11 4,5

Port Vlans allowed and active in management domain
Gi1/0/11 4,5

Port Vlans in spanning tree forwarding state and not pruned
Gi1/0/11 4,5
-------------------------------------------------------------------------
#sho int GigabitEthernet1/0/11
GigabitEthernet1/0/11 is up, line protocol is up (connected)
Hardware is Gigabit Ethernet, address is 0011.bb90.028c (bia
0011.bb90.028c)
Description: Trank
MTU 1500 bytes, BW 100000 Kbit, DLY 100 usec,
reliability 255/255, txload 38/255, rxload 65/255
Encapsulation ARPA, loopback not set
Keepalive set (10 sec)
Full-duplex, 100Mb/s, media type is 10/100/1000BaseTX
input flow-control is off, output flow-control is unsupported
ARP type: ARPA, ARP Timeout 04:00:00
Last input never, output 00:00:00, output hang never
Last clearing of "show interface" counters never
Input queue: 0/75/0/0 (size/max/drops/flushes); Total output drops: 10459
Queueing strategy: fifo
Output queue: 0/40 (size/max)
5 minute input rate 25760000 bits/sec, 4470 packets/sec
5 minute output rate 15030000 bits/sec, 8397 packets/sec
21752818 packets input, 15158711406 bytes, 0 no buffer
Received 12 broadcasts (0 multicasts)
0 runts, 0 giants, 0 throttles
0 input errors, 0 CRC, 0 frame, 0 overrun, 0 ignored
0 watchdog, 0 multicast, 96680 pause input
0 input packets with dribble condition detected
39185409 packets output, 9428531664 bytes, 0 underruns
0 output errors, 0 collisions, 0 interface resets
0 babbles, 0 late collision, 0 deferred
0 lost carrier, 0 no carrier, 0 PAUSE output
0 output buffer failures, 0 output buffers swapped out

длинк
create vlan vlan1 tag 4
config vlan vlan1 add tagged 1,9 advertisement disable

create vlan vlan2 tag 5
config vlan vlan2 add tagged 1,9 advertisement disable

disable gvrp
disable vlan_trunk
config gvrp 1,3-9,12-13,15-17,25-26 state disable ingress_checking enable acceptable_frame admit_all pvid 1

Если со стороны cisco дать:
int gi1/0/11
sw trun nat vl 1005

Со стороны D-Link включить ингресс чекинг, будет ли расти счетчик VlanIngDr?

А какая скорость на этом стыке? Что то типа show packet ports 49 и sh ports 49 det есть в этой серии есть? Покажите сюда вывод команд этих.