Хочу настроить данные фишки на коммутаторах, что бы избавиться от нежательных проблем, т.к. в последнее время что-то участились случаи.

Понял что размеры trashold-а все это сугубо индивидуально и зависит от нагрузки и размеров сети.

Подскажите как можно их померять и снять эти данные по snmp? ну то есть что бы потратить некоторе время на изучения "средних" значений и уже потом выставить и настроить коммутаторы?

И еще не подскажете какими программами можно воспользоваться что бы искусственно создать шторм и проверить как будет вести себя коммутатор при разных нагрузках?

По snmp вы можете снимать счетчики по интерфейсам.
Искусственно создать шторм можно, к примеру, с помощью Packet Player, проиграв какой-нибудь большой снифф с броадкастом в порт в режиме burst.