ИМХО лотерея получается.
Примерно бОльшая часть линков циска-длинк работает сразу и нормально, а вот оставшаяся часть - либо линк не поднимается, либо поднимается, но трафик не ходит.
А циска-циска и длинк-длинк работают стопроцентно (естественно, все рабочее, номиналы одинаковые, патч-корды соотвествуют).
Если есть временно два цискиных модуля, предлагаю сделать так:
подключить и все настроить на цискиных модулях, дабы убедиться, что все работает именно как надо;
заменить в длинке цискин модуль на длинковский и посмотреть результат - проблемы настроек были решены заранее, так что остается физика - либо заработает, либо нет.