У меня ситуация следующая - есть DNS-325 с одним диском заполненным на 89%. На диске достаточно большая вложенность папок - примерно 6 уровней + количество папок около 1000. При создании папки NAS тратит около 10-15 сек на ее создание.

Как вернуть былую производительность? Как провести дефрагментацию, хотя многие на других форумах утверждают, что она не нужна для ext3?

У меня была похожая проблема. В dmesg увидел "error I/O hdd". Тест SMART ничего внятного не показал. Вытащил винт и прогнал fsck на линуксовой машине. Волосы дыбом стали от кол-ва логических ошибок (NAS был не на UPS, а свет переодически хлопал). В итоге слил все, что смог на другой винт (как оказалось часть каталогов уже не читалось), этот отформатил в NAS'e, вернул инфу назад и наступило счастье. Уже 4 мес., полет нормальный, NAS конечно теперь на UPS.