Здесь зеркалирование возможно только на одинаковых по объему дисках. Никаким образом использовать оставшееся место, скорее всего, не получится.
Да и вообще будьте осторожны с заменой одного диска. Вполне возможно, что при форматировании вы отформатируете старый, а не новый. Косяк есть.
Далее: если у вас WD последних серий, где используется сектор 4 Кб то еще одна проблема. Почитать здесь
http://wdc.com/ru/products/advancedformat/
Грубо говоря это Windows диски или Mac, но уж точно не Linux NAS. Подозреваю, что в обычном Linux все уже доработали и подправили. Но на NAS никто нечего пока не менял.