Есть DES-6300, к нему подключены пару DES-3226S и Catalyst2950T, к Catalyst2950T еще пару Calalyst-ов(они объединены в кластер). Чтобы сделать DES-6300 корневым, присваиваю ему наименший приоритет. Разрешаю STP на всех коммутаторах. На всех D-link-ах при просмотре STP показывает, что DES-6300 корневой, на Catalyst-ах для VLAN 1(default) корневой DES-6300, для остальных VLAN корневой Catalyst2950T.
Что мешает, почему для VLAN 1 catalyst-ы и D-Link договорились, а для остальных нет и как с этим бороться?

Скорее всего на каталистах включен MSTP, там дерево своё для каждого VLAN'а. DES-3226s так не умеет, поэтому договаривается нормально.

Спасибо. Но тогда может быть кто знает как заставить каталисты работать по протоколу RSTP или STP, которые поддерживаются DES-3226s и DES-6300

хммм... скорее, на catalyst 2950T ВЫКЛЮЧЕН режим MST для протокола spanning tree. AFAIR по умолчанию catalyst работает в режиме PVST - то есть, свое дерево для каждой ВЛС. Этот режим НЕ СОВМЕСТИМ с обычным (R)STP, поскольку форматы кадров BPDU не совпадают. Напротив, при переводе 2950T в режим MST (теоретически, это стандарт 802.1s - практически же, как всегда, "с улучшениями" cisco - пока мне не удалось подружить DES-3526 и catalyst) все должно работать нормально, поскольку спецификация MSTP позволяет совместную работу с устройствами, умеющими только (R)STP.

P.S. из серии 2950 в режим MST могут быть переведены только модели 2950T/G