1) Смогут ли договориться между собой 100Base-FX и 1000Base-SX о 100Mbit'ах если их зацепить по многомоду метров на 200. И соответственно подовпросик (если вдруг смогут, то скорее всего тип разъемов на это влиять никак не будет, лишь бы совпадал с разъемом на самом комутаторе в точке подключения - так ли это?)

2) Если соединяют оптикой по одной жиле, то как тогда работает в другую сторону? Или по оптике всегда соединяют двумя жилами?

1. не смогут
2.обычно по двум жилам. Хотя сейчас есть оборудование, позволяющее работать по одной жиле и на прием, и на передачу. Используются разные длины волны. D-Link DMC-920 как пример.