Такой коммутатор /А1А H/W Ver A1 F/W 1.30.007
некоторые соединения не поднимаются на гигабит, переключаю в другой свич - гигабит без проблем, во всяком случае лампочки горят, и таких соединений около десятка.
Стоит указанная прошивка. Не понял, можно ли ставить прошивки с индексом "B" вроде 1.30.B028

Ставить прошивки с индексом "B" можно.
Рекомендуемая версия прошивки для DGS-1510-52 A1 - 1.33.B001, скачать её можно по ссылке:
http://dlink.ru/ru/products/1/1902_d.html

В отношении поднятия линков - проверьте совместим ли Ваш трансивер с коммутатором:
http://dlink.ru/ru/products/1/1902_o.html

гигабит по меди не поднимается, ставит 100 мегабит и все
в другой d-link, другой модели втыкаю - гигабит показывает.

Проверил, у меня без проблем на 1 Гбите линк поднимается, как с ПК, так и с 2 другими коммутаторами. Настройки портов стандартные?

Все стандартно, авто скорость, авто дуплекс
еще беда, при попытке прошить, через network assistant, прошивка проходит до конца потом ошибка "not enough space"
через web интерфейс - прошивка проходит до конца - перезагрузка - система говорит что старая прошивка

При прошивке через веб-интерфейс, после прошивки нужно зайти в раздел Management > File System > C > и справа напротив нужной прошивки (в Вашем случае DGS-1510_Run_1.33.B001.had) нажать кнопку Boot up. Тогда, после перезагрузки свитча прошивка обновится.

Ошибка "not enough space" возникает из-за того, что флешка коммутатора переполнена. Вначале перед прошивкой нужно в этом же разделе удалить ненужные файлы прошивки и конфиги (кнопочка Delete). После этого, через DNA свитч шьется успешно.

Спасибо, не увидел этого в руководстве.
Прошил. Ситуация с линками не поменялась (

Какой функционал настроен на свитче на проблемных портах (где не поднимается линк)?

Никакого. настройки по-умолчанию